Ученица первого класса старшей школы (аналог десятого класса в России) — персонаж, на котором сосредоточен сюжет повествования. Одноклассники считают её эксцентричной, вспыльчивой, но очень красивой. Харухи хорошо проявляет себя в спорте и по большинству предметов общего курса выступает «получше многих». Умеет хорошо петь и играет на гитаре, знает английский язык, неплохо дерётся, сообразительна и наблюдательна. В общественной жизни никакого участия не принимает, упорно избегает общения и большинству посторонних кажется нелюдимой. По её же словам, её интересуют только пришельцы, гости из будущего, параллельных миров, экстрасенсы и другие загадочные личности. Обычные люди раздражают её, она не желает иметь с ними никаких дел. От скуки Харухи даже основала школьный кружок «Команда SOS», посвящённый поискам инопланетян, призраков и вообще всего необычного.
Перед тем как Харухи создала «Команду SOS», она вступала на пару дней в каждый из уже существующих кружков своей школы, чтобы проверить, есть ли там что-нибудь интересное. Но все варианты были отвергнуты после непродолжительного рассмотрения, поскольку не смогли ничем удивить и заинтересовать Судзумию, хотя в большинстве кружков были бы рады видеть её в своих рядах из-за успехов Харухи в школьных дисциплинах.
У Харухи есть несколько странностей. Например, она каждый день недели носила разные причёски и бантики определённого цвета, пока Кён не сказал, что ему понравился «понедельниковский» вид. После этого она перестала менять причёски, отказавшись от косичек и выбрав жёлтую ленточку. Кроме того, Харухи не стеснялась одноклассников (позднее — неожидано для Кёна исправилась и вышибла его из клубной комнаты на время переодевания) и, к всеобщему смущению, могла переодеваться у всех на виду. Много раз мальчики приглашали её на свидания, но Харухи встречалась с ними всего от пяти минут до одной недели из-за того, что её совершенно не интересуют нормальные люди.
Харухи слишком серьёзна для своего возраста, относится к человеческим чувствам утилитарно и прозаично. Не хочет влюбляться, так как боится потерять из-за этого голову. Не ценит окружающих людей, относясь к ним, как к неодушевлённым объектам. Использует Асахину как сексуальную игрушку, которую она насильно раздевает и одевает в неприличные костюмы, фотографируя её в «сногсшибательных» позах. Завидует размеру груди Асахины, которая больше, чем у Судзумии, и постоянно норовит потрогать её. Во время спора с президентом компьютерного кружка сначала ставит на кон Юки и Асахину, а потом и себя.
Различные группы по разному объясняют природу Харухи. Пришельцы из будущего считают ее причиной времятрясения, мешающего им пройти в прошлое глубже чем на три года до начала событий сериала. Пришельцы из космоса считают что Харухи обладает уникальной способностью создавать новые данные и рассматривают ее как объект наблюдения, из которого можно почерпнуть знания для собственной эволюции. Группа экстрасенсов считает Харухи богиней, три года назад создавшей этот мир и столь желанных ею пришельцев, путешественников во времени и экстрасенсов.
Сэйю: Ая Хирано

Одноклассник Харухи, второй из основателей «Команды SOS». С некоторых пор в сознании окружающих он оказывается неразрывно связан с Харухи, поскольку является единственным, с кем она поддерживает диалог. Циничный, с постоянным сарказмом в голосе, Кён — единственный адекватный человек в команде Судзумии, и подчас ему приходится исправлять последствия проявлений чрезмерного энтузиазма Харухи. Кён самостоятельно выполняет для команды много черновой работы, результаты которой без всякого стыда присваивает себе Судзумия. Кроме того, он — самый обычный, ничем особенным не выделяющийся человек, в отличие от остальных членов кружка.
«Кён» — на самом деле прозвище, а не имя. Его «подарила» Кёну тётя, а распространила по школе младшая сестра, которая таким образом ехидно мстила Кёну за его нелюбовь к обращению «Онии-тян» («старший брат»). Настоящее имя персонажа не сообщается. И хотя в названии всех произведений франчайза и упоминается только Харухи Судзумия, история на самом деле излагается с точки зрения Кёна.
Хотя, это не нашло отражения в аниме, в первой книге посвященной Судзумии, Кён сам высказывает желание попасть в заварушку с пришельцами или чем то подобным. Но так как у него нет никаких супер-способностей, сразу же поправляется и соглашается на место помошника супер-героя, попинывающего поверженных врагов и веселящего зрителя[1]. И в общем-то именно этот принцип и получает развитие в дальнейшей истории.
Судзумия для него - почти как подруга детства, которая постоянно таскает его с собой. Одной из небольших радостей Кёна является Асахина, за которой он любит подглядывать. Хотя Кён не одобряет насильного обращения Судзумии с Асахиной, он бережёт её «сногсшибательные» фотографии, считая костюм служанки идеальным для неё. При этом Кён не возражал бы против того, чтобы Судзумия так же обращалась и с Юки, которую он тоже считает симпатичной, хотя, по его словам, он и не любит девушек в очках. Хотя Кён постоянно ворчит на команду SOS и не понимает зачем он там остается, в «Исчезновении Харухи Судзумии» у него была возможность получить мир, в котором не будет ничего из того что его так беспокоит — ни экстрасенсов, ни пришельцев. Тем не менее, он дважды отказался от предложенного мира, восстановил старый и признал, что нужно быть дураком, чтобы не любить жизнь, полную чудес.
Кён фактически является серым кардиналом команды SOS. Ближе к концу сериала Харухи решается фотографировать Асахину лишь тайком от Кёна. Нагато также прислушивается к его запрету/разрешению на применение своих способностей. В серии с таинственным островом Нагато не открывала Харухи на том основании, что она запретила открывать кому-либо, но Кён без труда отменил этот приказ и убедил Нагато открыть дверь.
Существует версия обратная версии «Корпорации», что Харухи является богиней. Некоторые считают богом именно Кёна, а Харуки - проекцией его желаний. Хотя это мало заметно в сериале, в книге гораздо больше аргументов стыкующихся с этой точкой зрения.
Сэйю: Томокадзу Сугита
Юки Нагато (яп. 長門 有希 Нагато Юки)

Единственная, кто оказалась в «Команде SOS» не по инициативе Харухи. Юки Нагато была участником литературного кружка, но перешла в команду Судзумии вместе со своей комнатой, которую та у литературного кружка отобрала. Юки всегда невозмутима, спокойна, не проявляет никаких эмоций и, похоже, вообще избегает разговоров — хотя и даёт прямые ответы, когда её спрашивают. Кроме любви к чтению и учёбе её отличает талант работы с компьютерами, которая доставляет ей настоящее удовольствие. Беспрекословно исполняет приказы Судзумии, как бы глупы они ни были.
На самом деле, Юки не человек, а «человекоподобный интерфейс», присланный на Землю межгалактическим сообществом информационных сущностей для расследования причины невероятно большого, по их меркам, «информационного взрыва», произошедшего здесь три года назад и исследования способностей Харухи. Юки способна манипулировать потоками данных Вселенной, что на практике даёт ей возможность вносить некоторые модификации в окружающий мир. Обычно носила очки, но перестала после того, как Кён сказал, что без очков она выглядит симпатичней.
В «Исчезновении Харухи Судзумии» Юки успешно украла силы Харухи и изменила воспоминания людей (в том числе и Судзумии) за последний год по своему вкусу, оставив, однако, последнее слово за Кёном (он мог либо принять новый мир, либо отменить его), что говорит о том, что она более могущественна, чем Харухи.
Сэйю: Минори Тихара

Гостья из будущего. Была в принудительном порядке принята в кружок распоряжением Харухи, которая искала в школе потенциальных участников и увидела Микуру, считающую ворон, в пустом кабинете второклассников (11 класс). Микуру пришлось выйти из клуба каллиграфии, чтобы вступить в «Команду SOS».
Основными причинами, по которым Харухи хотела заполучить в свой кружок Микуру, были её внешний вид, детское личико и большой размер груди. Харухи была уверена, что команде необходим такой человек в качестве талисмана, поскольку «только рядом с такими персонажами в мангах случается что-нибудь интересное».
По сравнению с остальными персонажами Микуру наивна и похожа на ребёнка. Она симпатична и мила, выглядит младше Судзумии, хотя считается, что она старше Харухи на один год и учится в следующем классе. Общество будущего откомандировало Микуру исследовать причину нарушения пространственно-временного континуума, возникшего три года назад, которое делает невозможными путешествия в прошлое на любые расстояния далее этого времени. Несмотря на то, что Асахина стесняется и сильно переживает от того, что Судзумия использует её как сексуальную игрушку, она терпит это каждый день. Интересуется странными вещами: например, как стать настоящей служанкой, или как правильно признаваться в любви. В «Причудах Харухи Судзумии» Коидзуми высказывал версию, что на самом деле поведение Асахины подобрано специально, что бы втесаться в доверие к Кёну, питающему слабость именно к такому типу девушек и через него иметь влияние на Судзумию. Впрочем, Коидзуми отшутился и сказал, что придумал все это лишь для того, что бы подколоть Кёна.
Сэйю: Юко Гото
Микуру Асахина (старшая) (яп. 朝比奈 みくる(大) Асахина Микуру (Дай))
Более «поздняя» Микуру Асахина, из ещё более отдалённого будущего. Кён называет её Асахина-сан (старшая), чтобы отличать старшую и младшую версии Микуру. К младшей Кён обращается Асахина-сан (младшая) (яп. 朝比奈さん(小) Асахина-сан (Сё)), если старшая находится где-нибудь поблизости. Она похожа на молодую женщину, груди которой стали ещё больше с возрастом, что смущает Кёна, но она по-прежнему так же наивна и глупа.
Сэйю: Юко Гото
Ицуки Коидзуми (яп. 古泉 一樹 Коидзуми Ицуки)

Обладатель сверхъестественных способностей, был принят в клуб как «таинственный новичок», поскольку то, что Коидзуми перевёлся в школу в середине учебного года, было, по мнению Харухи, довольно загадочно. Ицуки работает в секретной организации, известной под названием «Агентство» (яп. 「機関」), которая состоит из экстрасенсов, наделённых три года назад уникальными способностями. Организация также обеспечивает защиту человечества от «Божественных существ» (「神人」 синдзин), сражаясь с ними в отдельных слоях реальности, называемых «замкнутыми пространствами».
Коидзуми спокоен, уверен в себе, всегда улыбается и соглашается с любыми причудами Харухи без колебаний, даже не пытаясь сомневаться в их логике. Отчасти он поступает так потому, что считает Судзумию Богом и старается всегда поддерживать её в хорошем настроении, боясь того, что мир может ей наскучить и она ненароком его уничтожит. Ицуки часто даёт длинные детальные разъяснения, делая пространные жесты руками — что хорошо видно, например, в отснятом «Командой SOS» фильме. Со временем стал заместителем Судзумии.
Сэйю: Дайскэ Оно

Поначалу Рёко выглядит как обычная симпатичная старшеклассница, которая очень волнуется о Харухи и её отчужденности от одноклассников. У друга Кёна, Танагути, в его собственном рейтинге привлекательности школьниц, она находится в первой тройке и имеет уровень AA+.
Однако позже становится ясно, что она — страховка для Юки, и тоже является «человекоподобным интерфейсом». Она, так же как и Юки, понимает, что понять чувства людей сложно, но можно постараться выглядеть привлекательно для других. Сначала она охотно помогает Кёну сблизиться с Харухи, обычно со словами «открой её всему классу», но позже пытается убить его с помощью боевого ножа в надежде, что это приведёт к заметным изменениям в поведении Харухи. Ей не удалось этого сделать, так как её победила Юки и удалила из физического мира. Обычным людям сообщили, что Рёко уехала в Канаду.
Сэйю: Нацуко Куватани
Цуруя-сан (яп. 鶴屋さん)

Цуруя-сан — близкая школьная подруга Микуру-младшей. Самые заметные особенности Цуруи-сан — не сходящая с лица улыбка, постоянный смех по любому поводу и гиперактивный характер, из-за чего ее поведение часто вызывает удивление у окружающих. Большую часть информации о «Команде SOS» она получает от Микуру и часто говорит — «Я много о тебе слышала от Микуру».
Еще одной интересной особенностью являются очень длинные зеленые волосы, которые достигают её ступней, и маленький выступающий зуб, который заметен, когда она улыбается или смеётся.
Не являясь членом «Команды SOS», она играет важную роль в снимаемом ими фильме, «Приключения Микуры Асахины — Серия 00», и, кроме того, помогает бейсбольной команде Харухи в 4-й серии.
Имя Цуруи-сан так и небыло раскрыто.
Сэйю: Юки Мацуока
Танигути (яп. 谷口) и Куникида (яп. 国木田)

Танигути и Куникида — одноклассники и друзья Кёна. Танигути был в той же средней школе, что и Харухи. Они вместе играют в небольших эпизодах фильма «Приключения Микуры Асахины — Серия 00», где они почти не говорят. Танигути и Куникида — друзья и обычно они всегда вместе.
Танигути выглядит комедийно «озабоченным», у него есть свой личный рейтинг привлекательности школьниц, в котором каждая первоклассница старшей школы (примерно 10-й класс российской школы) занимает определённое место. Так как он знал Харухи в средней школе, Кён, до того как заговорил с ней, получал большую часть информации о Харухи именно от Танигути.
Куникида значительно более тихий, чем Танигути, обычно говорит позже остальных. Куникида такой же приземлённый человек, как и Кён.
Сэйю: Минору Сираиси и Сэйю: Мэгуми Мацумото

Ещё один персонаж, имя которого в сериале не раскрывается. Единственное, что о нём известно — это первая буква его имени — «Я». Ему и его клубу «посчастливилось» оказаться соседями с «Командой SOS», и с помощью шантажа Харухи конфискует у них самый лучший компьютер и заставляет провести Интернет. Он не собирался прощать этого и проверил сайт «Команды SOS», чтобы убедиться, что они действительно используют компьютер, и это стало одной из причин роста числа посетителей на счётчике сайта.
Он увлекается компьютерами и вместе с другими членами «Компьютерного Исследовательского Общества» разрабатывает собственную стратегическую игру, которую они назвали «День Стрельца III». Позже он вызывает «Команду SOS» на бой в этой игре, поставив 4 ноутбука на кон, а со стороны «Команды SOS» — возврат конфискованного компьютера. Обнаружив, что «Компьютерное Исследовательское Общество» жульничает (используя так называемый «map-hack»[2] — возможность видеть всё игровое поле), «Команда SOS», с помощью способностей Юки, устраняет в процессе игры возможность жульничества и побеждает. Несмотря на потерю четырёх ноутбуков, Глава Общества доволен тем, что нашёл талантливого компьютерного хакера — Юки, с которой он договорился об участии в деятельности его кружка.
Сэйю: Нобуюки Кобуси
Эмири Кимидори (яп. 喜緑 江美里 Кимидори Эмири)

Второклассница, в серии «Мистерический Знак» сказала, что она девушка главы компьютерного кружка, но позже становится ясно, что он не знает, кто она такая. Кроме того, она является членом школьного совета.
Сэйю: Юри Сиратори
Глава Школьного Совета (яп. 生徒会長 Сэйтокай Тё)

Глава школьного совета. Реальное имя неизвестно. Персонаж не встречается в аниме.

Предположительно, далёкий знакомый Коидзуми. Является членом «Агентства». Участвовал в детективной инсценировке, предназначенной для профилактического разгона скуки у Харухи. Играл роль богатого владельца уединённого особняка на частном острове и якобы был убит своим младшим братом Ютакой в ссоре.
Сэйю: Кадзухико Иноуэ
Ютака Тамара (яп. 多丸 裕 Тамару Ютака)

Младший брат Кэйити. Член «Агентства». Играл роль убийцы в детективной инсценировке «Агентства».
Сэйю: Тосиюки Морикава
Соно Мори (яп. 森 園生 Мори Соно:)

Член «Агентства». Играла роль горничной в детективной инсценировке. Её манеры были настолько хороши, что Микуру пыталась скопировать их, для того, чтобы быть больше похожей на настоящую горничную в униформе.
Сэйю: Аканэ Омаэ
Арагава (яп. 新川)

Является членом «Агентства». Настоящее имя неизвестно. Играл роль дворецкого в детективной исценировке «Агентства».
Сэйю: Акио Оцука
Остальные персонажи
Сестра Кёна (яп. キョンの妹 Кён но Имо:то)

Не слишком много известно о младшей сестре Кёна. Её имя также остаётся в секрете, как и настоящее имя брата. К ней обычно обращаются как к младшей cестре Кёна (яп. キョンの妹 Кён но Имо:то) или сестрёнке (яп. 妹ちゃん Имо:то-тян). Ей 11 лет, учится в 5-м классе младшей школы. У неё есть любимый кот — Сями. За весь аниме-сериал у неё всего несколько сцен, где она говорит.
Она — беззаботная и весёлая: например, она спряталась в сумке Кёна, чтобы вместе с ним отправиться на отдых. Она очень понравилась всем членам «Команды SOS», особенно Микуру, с которой она общается как с сестрой.
От неё друзья брата узнали его прозвище. Она услышала, что тётя зовёт его «Кён» и стала звать его так же. Когда друзья были у него дома, они переняли прозвище от сестры и стали называть его так в школе, что совсем не радовало Кёна, но забавляло сестру.
Сэйю: Саяка Аоки
Сямисэн (яп. シャミセン)

Серый кот, стал питомцем Кёна по приказу Харухи. Во время съёмок фильма «Приключения Микуры Асахины» Харухи, изменив действительность, временно наделяет его возможностью говорить. В аниме Юки назвала это чревовещанием. Сестра Кёна даёт ему кличку — Сями, и проводит с ним дома большую часть времени.
Сэйю: Кэнъити Огата